Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ttc21bQ0HA38 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ttc21bQ0HA38 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms