Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxc4Q08624 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms