Protein–RNA interactions for Protein: Q08331

Calb2, Calretinin, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb2Q08331 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Calb2Q08331 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms