Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tgm3Q08189 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tgm3Q08189 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms