Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms