Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Col9a2Q07643 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms