Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AmbpQ07456 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
AmbpQ07456 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms