Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sox4Q06831 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms