Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sh3bp2Q06649 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp2Q06649 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms