Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atf4Q06507 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atf4Q06507 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms