Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx2Q06348 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms