Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cab39Q06138 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cab39Q06138 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms