Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Fmn1Q05860 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fmn1Q05860 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms