Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sox12Q04890 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sox12Q04890 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms