Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms