Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Emx2Q04744 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms