Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smarcad1Q04692 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smarcad1Q04692 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms