Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smpd1Q04519 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms