Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tff2Q03404 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tff2Q03404 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms