Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ddr1Q03146 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms