Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Col6a2Q02788 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col6a2Q02788 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms