Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htr1fQ02284 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms