Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PrkcqQ02111 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms