Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ascl1Q02067 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms