Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VcpQ01853 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VcpQ01853 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms