Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Hoxd1Q01822 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms