Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nme2Q01768 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nme2Q01768 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms