Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
HmgcrQ01237 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HmgcrQ01237 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms