Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Grin2bQ01097 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms