Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pde1bQ01065 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pde1bQ01065 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms