Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pde4dQ01063 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pde4dQ01063 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms