Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PrcdQ00LT2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PrcdQ00LT2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms