Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rbp1Q00915 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rbp1Q00915 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms