Protein–RNA interactions for Protein: Q00560

Il6st, Interleukin-6 receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Il6stQ00560 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Il6stQ00560 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms