Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pax8Q00288 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pax8Q00288 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms