Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VldlrP98156 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VldlrP98156 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VldlrP98156 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms