Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cry1P97784 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cry1P97784 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cry1P97784 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms