Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx3-2P97503 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx3-2P97503 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms