Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcc1P97496 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smarcc1P97496 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms