Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pitx2P97474 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pitx2P97474 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms