Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cmklr1P97468 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms