Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Bop1P97452 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms