Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Crmp1P97427 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crmp1P97427 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crmp1P97427 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crmp1P97427 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crmp1P97427 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crmp1P97427 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crmp1P97427 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Crmp1P97427 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crmp1P97427 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crmp1P97427 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Crmp1P97427 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms