Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lig3P97386 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lig3P97386 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms