Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Meis3P97368 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Meis3P97368 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Meis3P97368 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Meis3P97368 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Meis3P97368 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Meis3P97368 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms