Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H3f3aP84244 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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