Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Arf1P84078 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Arf1P84078 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Arf1P84078 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Arf1P84078 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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Arf1P84078 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Arf1P84078 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf1P84078 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms