Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Otx2P80206 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Otx2P80206 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Otx2P80206 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms