Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Otx1P80205 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Otx1P80205 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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