Protein–RNA interactions for Protein: P70697

Urod, Uroporphyrinogen decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrodP70697 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
UrodP70697 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UrodP70697 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UrodP70697 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UrodP70697 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UrodP70697 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UrodP70697 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UrodP70697 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UrodP70697 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UrodP70697 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UrodP70697 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UrodP70697 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UrodP70697 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UrodP70697 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UrodP70697 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UrodP70697 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UrodP70697 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UrodP70697 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UrodP70697 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UrodP70697 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UrodP70697 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UrodP70697 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UrodP70697 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UrodP70697 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UrodP70697 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UrodP70697 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UrodP70697 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UrodP70697 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms